Atualmente o FGTS está sob o comando do Ministério do Trabalho. Porém, o presidente eleito, Jair Bolsonaro, já decidiu que o Ministério do Trabalho será extinto a partir do começo do ano e suas atribuições redistribuÃdas entre três Ministérios, o da Economia, da Justiça e da Cidadania.
O ministro extraordinário da transição, Onyx Lorenzoni, afirmou que o futuro Ministério da Economia ficará responsável pela gestão do FGTS, que reúne recursos dos trabalhadores e ajuda a financiar uma série de polÃticas públicas, entre elas, o Programa Minha Casa Minha Vida. O Ministério da Economia será comandado por Paulo Guedes.
